Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC144AA2RUR9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC144AA2RUR9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms