Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00312Q9Y6C7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms