Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAD54BQ9Y620 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms