Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms