Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KLF12Q9Y4X4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms