Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GIT1Q9Y2X7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms