Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM2AQ9Y2K7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM2AQ9Y2K7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms