Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
POMPQ9Y244 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms