Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX7Q9UNH6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms