Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBD1Q9UIS9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms