Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms