Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
COPS7AQ9UBW8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
COPS7AQ9UBW8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms