Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLKQ9UBT6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms