Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPG2Q9UBF2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms