Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL42Q9P2K6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms