Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP35Q9P2H5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms