Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MIS18AQ9NYP9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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MIS18AQ9NYP9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MIS18AQ9NYP9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MIS18AQ9NYP9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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MIS18AQ9NYP9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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MIS18AQ9NYP9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MIS18AQ9NYP9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MIS18AQ9NYP9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MIS18AQ9NYP9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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