Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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HOXC10Q9NYD6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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HOXC10Q9NYD6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXC10Q9NYD6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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