Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C2orf42Q9NWW7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C2orf42Q9NWW7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms