Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MED17Q9NVC6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms