Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SNX15Q9NRS6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SNX15Q9NRS6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SNX15Q9NRS6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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