Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSU72Q9NP77 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms