Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM54Q9BYV2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms