Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC023983.2-201ENST00000608010 562 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC017048.3-201ENST00000608775 813 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 CAMKMT-210ENST00000613618 594 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087742.2-201ENST00000616113 740 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007221.2-201ENST00000634367 948 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001469.3-202ENST00000430259 2014 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01343-201ENST00000431311 2283 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SHC4-203ENST00000537958 1447 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 C4BPB-201ENST00000243611 1117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFAIP8-201ENST00000274456 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP20-201ENST00000362752 313 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 PPM1N-202ENST00000396736 527 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN1P37-201ENST00000413805 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018866.1-202ENST00000421820 470 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL596330.1-201ENST00000431691 837 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL14P3-201ENST00000476715 622 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091175.1-201ENST00000522168 572 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 OR4A3P-201ENST00000532193 871 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF3J-AS1-204ENST00000560049 639 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms