Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCMBPQ9BTE3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCMBPQ9BTE3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms