Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM79Q9BSE2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms