Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBA1CQ9BQE3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms