Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC7Q96M83 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC7Q96M83 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms