Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCARF2Q96GP6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms