Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LINC00526Q96FQ7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms