Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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UBE2E3Q969T4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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UBE2E3Q969T4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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UBE2E3Q969T4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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UBE2E3Q969T4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2E3Q969T4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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