Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC9A6Q92581 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms