Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms