Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3C3Q8NEB9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms