Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLDN19Q8N6F1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN19Q8N6F1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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