Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS3Q8IXF0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPAS3Q8IXF0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms