Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC117Q8IWD4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms