Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV9

HPS6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6Q86YV9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPS6Q86YV9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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