Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms