Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms