Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NANOGNBQ7Z5D8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms