Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLASP1Q7Z460 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLASP1Q7Z460 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms