Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TCF23Q7RTU1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms