Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NLRP9Q7RTR0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms