Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
LINC00299Q6ZSB3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms