Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBLN3Q6UW01 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CBLN3Q6UW01 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CBLN3Q6UW01 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CBLN3Q6UW01 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBLN3Q6UW01 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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