Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED9Q6R2W3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED9Q6R2W3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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