Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPGRIP1LQ68CZ1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms