Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PRAMEF20Q5VT98 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF20Q5VT98 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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