Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP170Q5SW79 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP170Q5SW79 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms